乳腺癌中关键基因及靶向治疗化合物的筛选
刘敏,黄健,晏娇艳,杨烨,袁艳,何芸,宋孝晗,莫非,罗昭逊,张姝
摘要(Abstract)：
目的 筛选并验证乳腺癌(BC)中潜在的关键基因(Hub基因),探讨其在BC中的发生机制并寻找以Hub基因为靶点治疗BC的潜在化合物。方法 使用GEO2R在线工具从基因表达数据库(GEO)中获取BC中的差异表达基因(DEGs)后,利用基因表达谱数据动态分析(GEPIA)数据库和人类蛋白质图谱(HPA)数据库分别从mRNA水平和蛋白质层面进一步筛选潜在的Hub基因;采用逆转录-实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)、蛋白印迹(Western blot)和免疫组织化学染色法从mRNA水平和蛋白质层面对Hub基因在BC组与癌旁组的表达进行验证,绘制Hub基因的生存曲线,分析DEGs涉及的相关信号通路和调控机制,从Connectivity map(Cmap)数据库中筛选具有抗BC活性的候选化合物。结果 qRT-PCR、Western blot及免疫组织化学表明11个Hub基因及编码的蛋白在BC组中表达上调,功能分析表明,MELK、CDK1、HMMR和AURKA 4个基因与细胞周期调控相关,GINS2、RRM2和CDC45基因与DNA复制或修复相关,SMC4、PRC1和TOP2A与细胞分裂相关;Cmap数据库分析共鉴定出6个具有抗BC活性的候选化合物。结论 筛选出11个Hub基因,其表达与BC患者预后相关。
关键词(KeyWords)：
基因;乳腺肿瘤;化合物;生物信息学;生存曲线
基金项目(Foundation):
作者(Author):
刘敏,黄健,晏娇艳,杨烨,袁艳,何芸,宋孝晗,莫非,罗昭逊,张姝
参考文献(References)：
文章评论(Comment)：
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