贵州医科大学学报

2019, (08) 1-5

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短短芽孢杆菌GZDF3嗜铁素合成酶基因Gene5693的生物信息学分析及原核表达

袁林;贾化可;盛淼淼;王兵;曾丽娜;刘红美;隆耀航

摘要(Abstract):

目的:从短短芽孢杆菌GZDF3菌株中克隆嗜铁素合成酶基因Gene5693,构建其原核表达载体并进行重组表达。方法:利用antiSMASH软件对GZDF3全基因组序列进行次级代谢物预测分析,然后采用ExPASy在线分析预测嗜铁素合成酶基因Gene5693的基本理化性质并进行重组表达。结果:生物信息学分析结果显示,短短芽孢杆菌GZDF3全基因组序列与Petrobactin嗜铁素基因簇的相似性为83%,Gene5693基因编码的蛋白与Petrobactin嗜铁素编码的蛋白AsbE的相似性为51.06%;Gene5693编码蛋白氨基酸长度为327个氨基酸,分子量为39.05kDa,等电点(pI)为4.94,为酸性亲水性蛋白;Gene5693基因的PCR扩增成功获得预测的Gene5693基因片段,菌落PCR及重组DNA分子的双酶切电泳结果显示成功构建重组质粒;SDS-PAGE结果表明Gene5693编码的蛋白大小与生物信息学预测的结果一致。结论:成功克隆了嗜铁素合成基因Gene5693,并进行了重组表达。

关键词(KeyWords): 嗜铁素;短短芽孢杆菌;生物信息学;原核表达;SDS-PAGE

Abstract:

Keywords:

基金项目(Foundation): 贵州省科技支撑计划[黔科合支撑(2017)2833];贵州医科大学医药生物技术工程研究中心(2016002);贵阳市联合基金的资助[(2017)5-33];贵州省科技计划项目[黔科合基础(2019)1253]

作者(Author): 袁林;贾化可;盛淼淼;王兵;曾丽娜;刘红美;隆耀航

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